1. 高性能计算
平台配置了一个具有GPU加速的独立计算集群和联想的云存储，可供SIAIS科研人员用于密集的计算应用和数据存储。平台可提供帐户设置、软件安装、数据可视化等其他的IT技术支持。
目前，SIAIS HPC Cluster安装有多种计算生物学、药物设计、Bioinformatics和Cryo-EM数据处理领域的专业软件和应用。包括：Schrodinger Suites，Gaussian 09 E01，Gromacs，NAMD，Rosetta，R，Python，Anaconda，ReLion3等。并可根据用户的需求和Cluster条件，安装指定软件和特定版本的软件（商业软件需提供正版授权）。
2. 高通量测序服务
平台配置了一台Illumina Hiseq 2500二代高通量测序仪和一台Nanopore MinION MK1B三代测序仪，以及建库和质检相关的全套仪器设备，可提供高通量测序相关的项目咨询、样本质检、测序文库构建，以及高通量测序的服务和技术支持。
测序仪器设备：
Illumina Hiseq 2500 System Nanopore MinION
质检仪器设备：
Agilent Bioanalyzer 2100 FlashGel System Qubit 4.0
其他设备：
μEncapsulator Bioruptor Pico
3. 生物信息学数据分析
平台提供通用序列分析、开源数据库或其他类型数据源的数据挖掘，提供各类二代及三代测序数据分析，包括Hi-C数据分析、ATAC-seq数据分析、RNA-seq数据分析、基因组的组装与注释、CRISPR g-RNA筛选、蛋白质组学数据分析、单细胞RNA-seq数据分析、BCR/TCR免疫组库分析、基因组突变分析、DEL文库测序数据分析等。
目前，平台可提供的商业软件有CLC Genomics Workbench，它是一款生物信息学综合分析工具，可用于基因组学和转录组学的数据分析。
4. 计算化学
计算化学在单分子性质或分子-分子相互作用的研究中有着非常重要的作用。平台提供分子对接、分子动力学模拟和量子化学计算等服务。
5. 培训服务
平台提供R编程、Linux基础培训，特定主题的生物信息学数据分析的培训，以及高通量测序相关的理论和实验应用的培训等。
怎么使用平台
如果您有高通量测序或者数据分析的需求，请下载相关的实验或数据递交表格，填写完整相应的内容，打印签字后交给平台工作人员，或者您也可以与平台人员取得联系，咨询相关技术问题，沟通确认后再递交表格。
联系人：蒋立春 博士
Email：jianglch@@shanghaitech.edu.cn
联系地址：上海市浦东新区华夏中路393号人字楼A102
联系电话：021-20684479
