近日，上海科技大学免疫化学研究所石硕与生命科学与技术学院池天教授在肿瘤学领域学术期刊Oncogene在线发表了题为“PIWIL1 activates the R2TP-TELO2-mTORC1 axis independently of piRNA to promote TOP mRNA translation in gastric cancer”的研究论文。该研究通过综合分析转录组、翻译组以及蛋白质组数据，首次揭示了PIWI蛋白家族成员PIWIL1通过“劫持”R2TP-TELO2复合物激活mTORC1通路，进而特异性驱动胃癌中5′端寡嘧啶序列（5′-terminal oligopyrimidine, TOP）mRNA翻译的非piRNA依赖的新型促癌机制，并提出了联合靶向PIWIL1与mTORC1通路的治疗策略。 胃癌是全球范围内高发且高死亡率的恶性肿瘤。目前，手术和化疗仍是胃癌的主要治疗手段，临床上迫切需要寻找特异且有效的分子治疗靶点。PIWIL1作为PAZ-PIWI结构域（PAZ-PIWI domain, PPD）蛋白家族成员，传统上被认为仅在生殖系统中通过piRNA引导发挥功

近日，上海科技大学免疫化学研究所许红涛/上海交通大学医学院附属第九人民医院马培翔/浙江工业大学侯卫合作在Cell 姊妹期刊Chem上发表了题为“Splint RNA-mediated single-stranded DNA-encoded library construction and label-free live-cell selection ”的研究，报道了一种夹板RNA介导单链DNA编码化合物库（ssDEL）编码方法和活细胞无标记筛选系统。DNA编码化合物库（DEL）技术是由上海科技大学免疫化学研究所已故创始所长Richard Lerner教授与Sydney Brenner教授提出的颠覆性药物苗头化合物发现技术，凭借高通量、低成本、大容量的核心优势，系统重构了传统药物分子筛选范式。类比生物学中心法则，DEL通过“化学中心法则” 将基因型（DNA编码序列）和表型（与DNA共价偶联的小分子）精准偶联，实现化学信息的遗传编码。经过30多年的发展，DEL已成为支撑基础研究与新疗法开发的基础性技术平台，其应用已显著超越苗头化合物发现范畴，广泛覆盖化学生物学探针设计、共价药物药效团

近日，上海科技大学免疫化学研究所白芳课题组与中科苏州药物研究院梅良和团队合作，在《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表题为“DeepDegradome: A Structure-Aware Deep Learning Framework for PROTAC and Ligand Generation Against Protein Targets”的研究论文，提出一种分子片段驱动、蛋白结构感知的药物设计算法框架，可实现小分子配体及其对应PROTAC（Proteolysis Targeting Chimera，蛋白降解靶向嵌合体）降解剂的从头设计，为药物研发提供了兼容多分子模态的自动化设计新工具。靶向蛋白降解（TPD）特别是PROTAC技术，已成为药物研发的前沿方向。传统PROTAC设计多局限于在已知配体间优化连接子，难以突破既有分子骨架，尤其对缺乏明确结合口袋的“难成药”靶标很难实现理性设计。基于片段的药物设计（FBDD）虽可通过组装低分子量片段探索广阔化学空间，但其实验流程依赖高灵敏度生物物理方法，限制了规模化应用。为解决这一瓶颈，本研究开发了DeepDegradome——首个基于

近日，应Cell Press期刊《化学趋势》（Trends in Chemistry）主编Jessica Pancholi博士的邀请，上海科技大学许红涛、上海交通大学马培翔及广州医科大学易伟联合团队在该刊在线发表题为《DNA-Compatible Chemistry for DNA-Encoded Libraries and Beyond》的综述论文。文章系统梳理了DNA兼容化学领域的最新研究进展，重点探讨其在传统DNA编码化合物库（DEL）构建之外的新兴应用场景，深入分析当前DEL合成面临的技术瓶颈，并对该领域未来发展方向提出前瞻性展望。DNA编码化合物库（DEL）技术的核心基于一个“化学中心法则”，即寡核苷酸作为相应化合物（表型）的可扩增条形码（基因型），在化学结构与其编码序列之间建立一一对应的直接关联（图1）。建库所用的分子砌块（building blocks, BB）通常通过线性、分支或环状拓扑结构进行组装，从而实现药物分子的从头构建。经过多年的持续发展，DEL技术已演变为推动基础科学研究与新型治疗药物开发的关键平台，其应用范围远不止于药物发现中的苗头化合物（hit）筛选，还涵