近日，上海科技大学免疫化学研究所白芳课题组与中科苏州药物研究院梅良和团队合作，在《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表题为“DeepDegradome: A Structure-Aware Deep Learning Framework for PROTAC and Ligand Generation Against Protein Targets”的研究论文，提出一种分子片段驱动、蛋白结构感知的药物设计算法框架，可实现小分子配体及其对应PROTAC（Proteolysis Targeting Chimera，蛋白降解靶向嵌合体）降解剂的从头设计，为药物研发提供了兼容多分子模态的自动化设计新工具。靶向蛋白降解（TPD）特别是PROTAC技术，已成为药物研发的前沿方向。传统PROTAC设计多局限于在已知配体间优化连接子，难以突破既有分子骨架，尤其对缺乏明确结合口袋的“难成药”靶标很难实现理性设计。基于片段的药物设计（FBDD）虽可通过组装低分子量片段探索广阔化学空间，但其实验流程依赖高灵敏度生物物理方法，限制了规模化应用。为解决这一瓶颈，本研究开发了DeepDegradome——首个基于

近日，应Cell Press期刊《化学趋势》（Trends in Chemistry）主编Jessica Pancholi博士的邀请，上海科技大学许红涛、上海交通大学马培翔及广州医科大学易伟联合团队在该刊在线发表题为《DNA-Compatible Chemistry for DNA-Encoded Libraries and Beyond》的综述论文。文章系统梳理了DNA兼容化学领域的最新研究进展，重点探讨其在传统DNA编码化合物库（DEL）构建之外的新兴应用场景，深入分析当前DEL合成面临的技术瓶颈，并对该领域未来发展方向提出前瞻性展望。DNA编码化合物库（DEL）技术的核心基于一个“化学中心法则”，即寡核苷酸作为相应化合物（表型）的可扩增条形码（基因型），在化学结构与其编码序列之间建立一一对应的直接关联（图1）。建库所用的分子砌块（building blocks, BB）通常通过线性、分支或环状拓扑结构进行组装，从而实现药物分子的从头构建。经过多年的持续发展，DEL技术已演变为推动基础科学研究与新型治疗药物开发的关键平台，其应用范围远不止于药物发现中的苗头化合物（hit）筛选，还涵

近日，上海科技大学免疫化学研究所与南开大学研究团队携手取得科研突破，成功研发出“基于双特异性抗体的FcγRⅡb受体介导溶酶体靶向嵌合体技术”（简称FcRTAC）。该技术可高效驱动受体介导的内吞过程，精准清除胞外可溶性靶点及病理性聚集体，为相关疾病的治疗提供了全新思路与通用技术平台。相关成果“Chimeras co-targeting antigens and FcγRIIb trigger degradation of extracellular soluble proteins and pathological aggregates”发表于学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）。

11月29日，上海科技大学免疫化学研究所张贺桥/Roger Kornberg研究团队（结构生物化学课题组）在国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了题为“Mechanistic insights into histone recognition and H3K14 acetylation by the NuA3 histone acetyltransferase complex” 的研究论文，报道了真核生物组蛋白乙酰转移酶复合物NuA3与底物组蛋白H3尾部结合并特异性乙酰化H3K14位点的结构特征。